异度之刃2故事的开始是，男主莱克斯被邀请参与天之圣杯打捞行动，在遇见封印的天之圣杯—焰的时候，被同队的真穿刺胸膛而死。焰以将他复活为条件，请求莱克斯带她回现实中的，不知是否存在的故乡—乐园。莱克斯被充满忧郁悲伤气质的美丽少女吸引，出于感恩及倾慕，还有内心对于乐园的向往，决定协助她「回家」。

　　异度之刃2的最终结局

　　异度之刃2的结局是最后教皇靠着操控巨兽的力量，控制了所有的国家的巨兽在世界树下和真灭一行人展开了战舰决战，教皇方占小优势，结果因为男主的行动，让双方陷入混战。最后真被主角嘴遁感化，决定和教皇同归于尽而死。

　　最后boss就是灭，打败之后，因为奇点消失，女主为了全世界，自爆了。男主本来想和女主一起死，但是被众人拦下，带着女主的祝福，回到了地上。雾也消失了，剩余的巨兽在海上组成了新的大陆。最后随着ed响起，本以为是badending结果被反转。原来是女主的一丝残能原地复活了，大圆满结局。